آماده سازی لامهای نانوذرات فلورسنتی برای تعیین وضوح میکروسکوپ از اهمیت بالایی برخوردار است زیرا ایجاد هرگونه اشتباهی در هر یک از مراحل آماده سازی نمونه ها و دور شدن از آماده سازی دقیق و ایده آل منجر به خطا و انحراف در اندازه گیری تابع گسترش نقطه و تعیین اشتباه وضوح اجزای نوری میکروسکوپ و در نتیجه وضوح خود میکروسکوپ می شود.
کاربرد نانوذرات فلورسنتی با توجه به میزان دشواری آماده سازی آنها، محدوده آشکارسازی، تمایل خوشه ای شدن نانوذرات و فلورسانس پس زمینه، محدود می شود. تعدادی از این نانوذرات فلورسانس برای غلبه بر این مشکلات طراحی شده اند مانند رودامین، فلورسین، نیل قرمز و چند مورد دیگر اغلب برای آماده سازی کره های فلورسنتی مورد استفاده قرار می گیرند. از میان آن ها رودامین و فلورسین از زیست سازگاری خوبی برخوردار هستند، بازده کوانتومی بالا و ضریب خاموشی بالایی دارند.